Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLKQ9UBT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms