Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-18Q9QC07 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-18Q9QC07 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK-18Q9QC07 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms