Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRBP1Q9P2E9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms