Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH10Q9P2E7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH10Q9P2E7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms