Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXXC1Q9P0U4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms