Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L1Q9P0L9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L1Q9P0L9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms