Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP5Q9NZZ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms