Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM53CQ9NYF3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms