Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLCO1C1Q9NYB5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLCO1C1Q9NYB5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms