Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH5Q9NX47 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH5Q9NX47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms