Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLN6Q9NWW5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms