Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms