Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATG3Q9NT62 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATG3Q9NT62 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms