Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPMQ9NSP4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CENPMQ9NSP4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms