Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C8orf4Q9NR00 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf4Q9NR00 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms