Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPHNQ9NQX3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPHNQ9NQX3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms