Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NRIP3Q9NQ35 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NRIP3Q9NQ35 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms