Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNB1IP1Q9NPC3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms