Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CWC22Q9HCG8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CWC22Q9HCG8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC22Q9HCG8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC22Q9HCG8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CWC22Q9HCG8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms