Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CENPJQ9HC77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms