Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN28AQ9H9Z2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN28AQ9H9Z2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms