Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms