Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX5Q9H2C1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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