Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC8Q9H0W5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC8Q9H0W5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC8Q9H0W5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms