Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBPF3Q9H094 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF3Q9H094 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms