Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIF3L1Q9GZT8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms