Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDGFDQ9GZP0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms