Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER1Q9C0I3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER1Q9C0I3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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