Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NLRP1Q9C000 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NLRP1Q9C000 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms