Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUS3Q9BZE2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUS3Q9BZE2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUS3Q9BZE2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUS3Q9BZE2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PUS3Q9BZE2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PUS3Q9BZE2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PUS3Q9BZE2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms