Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUF2Q9BZD4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms