Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSD3Q9BZ95 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSD3Q9BZ95 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSD3Q9BZ95 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms