Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM55Q9BYV6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms