Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC3Q9BY71 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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