Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms