Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD2AQ9BW72 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIGD2AQ9BW72 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms