Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1orf50Q9BV19 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms