Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDFIP1Q9BT67 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms