Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms