Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPIN3Q9BQK8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPIN3Q9BQK8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms