Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOL4Q9BPW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms