Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMD1Q99460 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD1Q99460 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms