Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT140Q96RY7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT140Q96RY7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 547.3 ms