Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms