Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA5Q96PV4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNMA5Q96PV4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms