Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCLT1Q96NL6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms