Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD8Q96LT4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD8Q96LT4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms