Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C2orf48Q96LS8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms