Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC12Q96J65 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms