Protein–RNA interactions for Protein: Q96HZ4

HES6, Transcription cofactor HES-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES6Q96HZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES6Q96HZ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES6Q96HZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms